Подключаемся к хосту по SSH;
Проверяем наличие утилиты vmkfstools;
Выполняем команду
vmkfstools -i /vmfs/volumes/datastore1/VM1/disk_1.vmdk -d zeroedthick /vmfs/volumes/datastore1/VM1/disk_1_new.vmdk
Ожидаем конвертацию (на диск 10G ушло 5 мин)
Меняем местами в настройках диск с disk_1.vmdk на исправленный disk_1_new.vmdk или просто переименовываем.
Запускаем машину и наслаждаемся работой.